לצורך הקמת המסילה הרביעית ברצועת איילון, נדרש לבצע שינויים הנדסיים בתעלת איילון בכדי לאפשר את הקמת המסילה, תוך אפשרות זרימה מקסימלית בתעלה. לצורך כך בוצע מודל הידראולי דו-ממדי וחד ממדי משולב, הבוחן את הזרימות בתעלת איילון במצב הקיים טרם הקמת המסילה הרביעית ובמצב המוצע לאחר הקמת המסילה הרביעית על כל המתקנים שלה. בין היתר, המודל מאפשר לבחון את תפקוד התעלה באירועים הידרולוגים שונים, נותן תמונה מיטבית של מצב ההצפות ברצועת איילון בתרחישים שונים, מסמן 'צווארי הבקבוק' המגבילים את כושר ההזרמה בתעלה והינו כלי תומך החלטה להתמודדות עם אירועים הידרולוגים קיצוניים.